Ο πρόεδρος της Ένωσης Κεντρώων Βασίλης Λεβέντης σχολίασε την υπογραφή της συμφωνίας στις Πρέσπες αναφέροντας χαρακτηριστικά:
«Ο κ. Τσίπρας χωρίς σύγκληση του Συμβουλίου των πολιτικών αρχηγών, υπό τον Πρόεδρο της Δημοκρατίας, χωρίς καν την άδεια της Βουλής, πήγε στις Πρέσπες και έβαλε μια υπογραφή παρά την θέληση του ελληνικού λαού, ενώ είναι ξεσηκωμένη εναντίον του όλη η Μακεδονία. Ακούσαμε τον κ. Ζάεφ να μας λέει, ότι δείξαμε ανδρεία εμείς οι Έλληνες και πως αυτός εκπροσωπεί τους Μακεδόνες.
Η Ένωση Κεντρώων θεωρεί φαρσοκωμωδία την όλη υπόθεση και δεσμεύεται στο λαό της Μακεδονίας, ότι τα χαρτιά που συνυπογράψανε, ο κ. Τσίπρας και ο κ. Ζάεφ θα τα πετάξουμε στο καλάθι των αχρήστων.
Οι ένοχοι θα τιμωρηθούν από το λαό».